Comment envoyer et recevoir efficacement des tableaux 2D dans MPI ?

Envoi et réception de tableaux 2D à l'aide de MPI

Problème :

Vous disposez d'une grande matrice 2D qui nécessite un traitement sur plusieurs nœuds utilisant MPI. La seule communication entre les nœuds implique le partage des valeurs de bord après chaque pas de temps.

Approche :

L'approche que vous proposez, décrite dans la question, est adaptée à ce problème. Les segments de code suivants illustrent l'implémentation suggérée :

// (assume A is a 2D array)
if (myrank == 0) {
  for (i = 0; i < x; i++) {
    for (j = 0; j < y; j++) {
      // Perform C++ code implementation
      MPI_Send(&A[i][0], 3, MPI_INT, 1, 0, MPI_COMM_WORLD);
      MPI_Recv(&B[0][0], 3, MPI_INT, 1, 0, MPI_COMM_WORLD, &status);
      MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD);
    }
  }
}

if (myrank == 1) {
  for (i = x; i < xx; i++) {
    for (j = 0; j < y; j++) {
      // Perform C++ code implementation
      MPI_Send(&B[i][0], 3, MPI_INT, 0, 0, MPI_COMM_WORLD);
      MPI_Recv(&A[0][0], 3, MPI_INT, 0, 0, MPI_COMM_WORLD, &status);
      MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD);
    }
  }
}

Fonctions MPI supplémentaires :

• MPI_Allgather : collecte les données de tous les processeurs dans un tampon accessible à tous les processeurs. Utile pour collecter un tableau distribué sur un seul processeur.
• MPI_Alltoall : Fournit un échange complet de données entre tous les processeurs.
• MPI_Sendrecv : A fonction pratique qui combine une opération d'envoi et de réception en un seul appel.
• MPI_Buffer_attach : Attache un tampon à un processus, sans avoir besoin de lui allouer explicitement de la mémoire.

Considérations :

• Une allocation de mémoire contiguë est recommandée pour les tableaux 2D afin de simplifier la communication MPI.
• MPI_Barrier assure la synchronisation entre les processus, mais il peut être remplacé avec des alternatives non bloquantes comme MPI_Wait ou MPI_Test.
• Les envois et réceptions bloquants sont utilisés ici, mais des options non bloquantes sont disponibles pour une efficacité accrue.

Ce qui précède est le contenu détaillé de. pour plus d'informations, suivez d'autres articles connexes sur le site Web de PHP en chinois!