優化平行數據處理的Python
Python可以使用正確的工具和方法有效地處理並行數據處理。首先,使用多處理而不是用於綁定CPU的任務的線程繞過全局解釋器鎖(GIL)。其次,利用多處理。對並行地圖/減少模式,同時對過程間通信保持謹慎,並確保可憐的功能和數據。第三,考慮Dask或Joblib處理大於內存數據集或批處理工作負載,其中Dask擴展了Pandas和Numpy的並行性,而Joblib簡化了並行循環,尤其是在機器學習中。第四,通過使用共享存儲器,避免冗餘數據傳輸,預加載和塊數據以及管理文件仔細寫入來優化數據共享。最後,使用Numba或Cython進行關鍵績效部分,將它們與多處理結合在一起,以達到接近C的速度和更好的總體效率。
Python並不總是進行高性能計算的首選,但是有了正確的工具和結構,它可以有效地處理並行數據處理。關鍵是知道如何處理其限制(例如全球解釋器鎖(GIL)),並為您的任務選擇正確的庫和執行模型。

使用多處理而不是將CPU結合任務的線程
Python中的線程非常適合I/O結合的任務,例如下載文件或等待網絡響應。但是,對於CPU使用情況很重的數據處理,由於GIL,線程撞擊牆,這僅允許一個線程一次執行Python字節碼。
多處理通過產卵單獨的過程,每個過程都有自己的python解釋器和內存空間。這意味著真正的並行執行。

- 使用
multiprocessing.Pool
以易於並行地圖/減少模式 - 謹慎對待過程中的通信 - 如果您通過大型數據結構,它會變得慢
- 序列化(使用泡菜)發生在幕後,因此請確保您的功能和數據是可挑選的
例如,如果您要對大列表中的每個項目應用重函數, Pool.map()
可以跨代碼更改的內核分發。
考慮使用Dask或Joblib,以大於內存或批處理工作負載
如果您正在使用不適合內存或想要更可擴展的方法的數據,則DASK是一個不錯的選擇。它通過並行和分佈式計算功能擴展了熊貓和numpy。

- DASK數據范圍像熊貓一樣工作,但可以處理大於RAM的數據
- dask.delayed()使您可以與最少的重構並行化自定義工作流程
- Dask可以從筆記本電腦擴展到群集,而無需更改代碼
Joblib是另一個輕量級選項,在機器學習工作流程中特別有用。它用於透明的磁盤緩存和簡單的並行循環。
- 使用
Parallel(n_jobs=-1)
使用所有CPU內核 - 非常適合通過不同輸入多次運行相同功能的循環
優化數據共享並減少開銷
處理並行過程時,數據複製和通信可能會成為瓶頸。這裡有幾種減少開銷的方法:
- 將共享存儲器與
multiprocessing.Value
multiprocessing.Array
- 避免反复在進程之間傳遞大型數據集 - 如果可能的話,每個進程一次加載數據
- 將數據預加載到塊中,並為每個過程分配一個塊以獨立處理
另外,請注意您如何閱讀和編寫文件。如果多個進程試圖寫入同一文件,您將遇到比賽條件。一個好的解決方法是將每個過程寫入單獨的文件並之後將其合併。
不要忽略Numba或Cython的性能至關重要部分
如果您正在進行大量的數值計算,請考慮使用Numba或Cython卸載該工作以編譯代碼。兩者都允許您編寫類似Python的代碼並獲得接近C的性能。
- NUMBA在Numpy陣列和數值循環中效果最好
- Cython通過讓您靜態鍵入變量並調用C功能,從而為您提供更多的控制
這些工具可以與多處理一起使用以獲得更好的性能。例如,使用多處理將數據分開,然後在每個過程中的NUMBA到CRUCH數字。
基本上就是這樣。 Python中的並行數據處理不一定是魔術。這更多的是選擇合適的工具來工作,並意識到瓶頸傾向於出現的位置。
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