自举法Bootstrap是什么
自举法检验(Bootstrap)
放回式抽样统计法。通过对数据集多次重复取样,构建多个进化树,用来检验你所计算的进化树分支可信度的。
简单地讲就是把序列的位点都重排,重排后的序列再用相同的办法构树,如果原来树的分枝在重排后构的树中也出现了,就给这个分枝打上一分,如果没出现就给0分,这样经过你给定的100-1000次重排构树打分后,每个分枝就都得出分值,计算机会给你换算成bootstrap值。
重排的序列有很多组合,值越大说明分枝的可信度越高。一般bootstrap值大于70%时该进化分支的存在被认为是被引导检测所支持的。最好根据数据的情况选用不同的构树方法和模型,以期获得更加可靠的结果。
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