Cython 三分钟入门教程-Python Tutorial-php.cn

作者：perrygeo译者：赖勇浩（http://laiyonghao.com）原文：http://www.perrygeo.net/wordpress/?p=116 我最喜欢的是Python，它的代码优雅而实用，可惜纯粹从速度上来看它比大多数语言都要慢。大多数人也认为的速度和易于使用是两极对立的——编写C代码的确非常痛苦。而 Cython 试图消除这种两重性，并让你同时拥有 Python 的语法和 C 数据类型和函数——它们两个都是世界上最好的。请记住，我绝不是我在这方面的专家，这是我的第一次Cython真实体验的笔记：编辑：根据一些我收到的反馈，大家似乎有点混淆——Cython是用来生成 C 扩展到而不是独立的程序的。所有的加速都是针对一个已经存在的 Python 应用的一个函数进行的。没有使用 C 或 Lisp 重写整个应用程序，也没有手写C扩展。只是用一个简单的方法来整合C的速度和C数据类型到 Python 函数中去。现在可以说，我们能使下文的 great_circle 函数更快。所谓 great_circle 是计算沿地球表面两点之间的距离的问题： p1.py import math def great_circle(lon1,lat1,lon2,lat2): radius = 3956 #miles x = math.pi/180.0 a = (90.0-lat1)*(x) b = (90.0-lat2)*(x) theta = (lon2-lon1)*(x) c = math.acos((math.cos(a)*math.cos(b)) + (math.sin(a)*math.sin(b)*math.cos(theta))) return radius*c 让我们调用它 50 万次并测定它的时间： import timeit lon1, lat1, lon2, lat2 = -72.345, 34.323, -61.823, 54.826 num = 500000 t = timeit.Timer("p1.great_circle(%f,%f,%f,%f)" % (lon1,lat1,lon2,lat2), "import p1") print "Pure python function", t.timeit(num), "sec" 约2.2秒。它太慢了！让我们试着快速地用Cython改写它，然后看看是否有差别：c1.pyx import math def great_circle(float lon1,float lat1,float lon2,float lat2): cdef float radius = 3956.0 cdef float pi = 3.14159265 cdef float x = pi/180.0 cdef float a,b,theta,c a = (90.0-lat1)*(x) b = (90.0-lat2)*(x) theta = (lon2-lon1)*(x) c = math.acos((math.cos(a)*math.cos(b)) + (math.sin(a)*math.sin(b)*math.cos(theta))) return radius*c 请注意，我们仍然import math——cython让您在一定程度上混搭Python和C数据类型在。转换是自动的，但并非没有代价。在这个例子中我们所做的就是定义一个Python函数，声明它的输入参数是浮点数类型，并为所有变量声明类型为C浮点数据类型。计算部分它仍然使用了Python的 math 模块。现在我们需要将其转换为C代码再编译为Python扩展。完成这一部的最好的办法是编写一个名为setup.py发布脚本。但是，现在我们用手工方式，以了解其中的巫术： # this will create a c1.c file - the C source code to build a python extension cython c1.pyx # Compile the object file gcc -c -fPIC -I/usr/include/python2.5/ c1.c # Link it into a shared library gcc -shared c1.o -o c1.so 现在你应该有一个c1.so（或.dll）文件，它可以被Python import。现在运行一下： t = timeit.Timer("c1.great_circle(%f,%f,%f,%f)" % (lon1,lat1,lon2,lat2), "import c1") print "Cython function (still using python math)", t.timeit(num), "s 约1.8秒。并没有我们一开始期望的那种大大的性能提升。使用 python 的 match 模块应该是瓶颈。现在让我们使用C标准库替代之： c2.pyx cdef extern from "math.h": float cosf(float theta) float sinf(float theta) float acosf(float theta) def great_circle(float lon1,float lat1,float lon2,float lat2): cdef float radius = 3956.0 cdef float pi = 3.14159265 cdef float x = pi/180.0 cdef float a,b,theta,c a = (90.0-lat1)*(x) b = (90.0-lat2)*(x) theta = (lon2-lon1)*(x) c = acosf((cosf(a)*cosf(b)) + (sinf(a)*sinf(b)*cosf(theta))) return radius*cec" 与 import math 相应，我们使用cdef extern 的方式使用从指定头文件声明函数（在此就是使用C标准库的math.h）。我们替代了代价高昂的的Python函数，然后建立新的共享库，并重新测试： t = timeit.Timer("c2.great_circle(%f,%f,%f,%f)" % (lon1,lat1,lon2,lat2), "import c2") print "Cython function (using trig function from math.h)", t.timeit(num), "sec" 现在有点喜欢它了吧？0.4秒 -比纯Python函数有5倍的速度增长。我们还有什么方法可以再提高速度？c2.great_circle（）仍是一个Python函数调用，这意味着它产生Python的API的开销（构建参数元组等），如果我们可以写一个纯粹的C函数的话，我们也许能够加快速度。 c3.pyx cdef extern from "math.h": float cosf(float theta) float sinf(float theta) float acosf(float theta) cdef float _great_circle(float lon1,float lat1,float lon2,float lat2): cdef float radius = 3956.0 cdef float pi = 3.14159265 cdef float x = pi/180.0 cdef float a,b,theta,c a = (90.0-lat1)*(x) b = (90.0-lat2)*(x) theta = (lon2-lon1)*(x) c = acosf((cosf(a)*cosf(b)) + (sinf(a)*sinf(b)*cosf(theta))) return radius*c def great_circle(float lon1,float lat1,float lon2,float lat2,int num): cdef int i cdef float x for i from 0 x = _great_circle(lon1,lat1,lon2,lat2) return x 请注意，我们仍然有一个Python函数（ def ），它接受一个额外的参数 num。这个函数里的循环使用for i from 0 为了证明我们所做的已经足够优化，可以用纯C写一个小应用，然后测定时间： #include

#include

#define NUM 500000

float great_circle(float lon1, float lat1, float lon2, float lat2){

float radius = 3956.0;

float pi = 3.14159265;

float x = pi/180.0;

float a,b,theta,c;

a = (90.0-lat1)*(x);

b = (90.0-lat2)*(x);

theta = (lon2-lon1)*(x);

c = acos((cos(a)*cos(b)) + (sin(a)*sin(b)*cos(theta)));

return radius*c;