Python 自带的 IDLE 就可以做到了，你开启一个 python file 后 run module，你会发现主控台上可以操控 file 中的 variable

Pycharm 的部分我自己试了一下，你进到 Run/Edit Configurations...

然后把 Interpreter options 加入 -i 的选项:

之后运行 script 完毕，shell 会 keep 在那边不会结束

其实不需要 ide 就可以做到你想做的了

假设你有一个 python script test.py

a = 5
b = [1, 2, 3]

直接用:

$ python -i test.py

运行 test.py 完毕后，Python 会停在 console 中可以继续互动

或是用:

$ python

开启 python shell 后，用 import 汇入 test 并执行，接着你就可以操控 variable 了:

>>> from test import *
>>> a
5
>>> b
[1, 2, 3]

这也有同样效果

我回答过的问题: Python-QA

相对原生python shell，iPython更加好用一些，另外集成Matplotlib之后可以画出类似matlab的图形。