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使用Python從頭開始手寫迴歸樹

PHPz
發布: 2023-04-14 11:46:02
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為了簡單起見這裡將使用遞歸來創建樹節點,雖然遞歸不是一個完美的實現,但是對於解釋原理他是最直觀的。

首先導入庫

import pandas as pd
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
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首先需要創建訓練數據,我們的數據將具有獨立變量(x)和一個相關的變量(y),並使用numpy在相關值中添加高斯噪聲,可以用數學表示為

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這裡的 是噪聲。程式碼如下所示。

def f(x):
mu, sigma = 0, 1.5
return -x**2 + x + 5 + np.random.normal(mu, sigma, 1)
num_points = 300
np.random.seed(1)

x = np.random.uniform(-2, 5, num_points)
y = np.array( [f(i) for i in x] )
plt.scatter(x, y, s = 5)
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回歸樹

在迴歸樹中是透過建立一個多個節點的樹來預測數值資料的。下圖展示了一個回歸樹的樹結構範例,其中每個節點都有其用於劃分資料的閾值。

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給定一組數據,輸入值將透過相應的規格達到葉子節點。達到節點M的所有輸入值可以用X的子集表示。從數學上講,讓我們用一個函數來表達此情況,如果給定的輸入值達到節點M,則可以給出1個,否則為0。

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找到分裂資料的閾值:透過在每個步驟中選擇2個連續點並計算其平均值來迭代訓練資料。計算的平均值將數據分為兩個的閾值。

首先讓我們考慮隨機閾值以演示任何給定的情況。

threshold = 1.5
low = np.take(y, np.where(x < threshold))
high = np.take(y, np.where(x > threshold))
plt.scatter(x, y, s = 5, label = 'Data')
plt.plot([threshold]*2, [-16, 10], 'b--', label = 'Threshold line')
plt.plot([-2, threshold], [low.mean()]*2, 'r--', label = 'Left child prediction line')
plt.plot([threshold, 5], [high.mean()]*2, 'r--', label = 'Right child prediction line')
plt.plot([-2, 5], [y.mean()]*2, 'g--', label = 'Node prediction line')
plt.legend()
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藍色垂直線表示單一閾值,我們假設它是任意兩點的平均值,並稍後將其用於劃分資料。

我們對這個問題的第一個預測是所有訓練資料(y軸)的平均值(綠色水平線)。而兩條紅線是要建立的子節點的預測。

很明顯這些平均值都不能很好地代表我們的數據,但它們的差異也是很明顯的:主節點預測(綠線)得到所有訓練數據的均值,我們將其分為2個子節點,這2個子節點有自己的預測(紅線)。與綠線相比這2個子節點更好地代表了它們對應的訓練資料。回歸樹就是將不斷地將資料分成2個部分-從每個節點建立2個子節點,直到達到給定的停止值(這是節點所能擁有的最小資料量)。它會提前停止樹的建造過程,我們稱之為預修剪樹。

為什麼會有早停的機制?如果我們要繼續進行分配直到節點只有一個值是,這創建一個過度擬合的方案,每個訓練資料都只能預測自己。

說明:當模型完成時,它不會使用根節點或任何中間節點來預測任何值;它將使用回歸樹的葉子(這將是樹的最後一個節點)進行預測。

為了得到最能代表給定閾值資料的閾值,我們使用殘差平方和。它可以在數學上定義為

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讓我們看看這一步是如何運作的。

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既然計算了閾值的SSR值,那麼可以採用具有最小SSR值的閾值。使用此閾值將訓練資料分為兩個(低和高部分),其中低部分將用於建立左子節點,高部分將用於建立右子節點。

def SSR(r, y): 
return np.sum( (r - y)**2 )

SSRs, thresholds = [], []
for i in range(len(x) - 1):
threshold = x[i:i+2].mean()

low = np.take(y, np.where(x < threshold))
high = np.take(y, np.where(x > threshold))

guess_low = low.mean()
guess_high = high.mean()

SSRs.append(SSR(low, guess_low) + SSR(high, guess_high))
thresholds.append(threshold)

print('Minimum residual is: {:.2f}'.format(min(SSRs)))
print('Corresponding threshold value is: {:.4f}'.format(thresholds[SSRs.index(min(SSRs))]))
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在进入下一步之前,我将使用pandas创建一个df,并创建一个用于寻找最佳阈值的方法。所有这些步骤都可以在没有pandas的情况下完成,这里使用他是因为比较方便。

df = pd.DataFrame(zip(x, y.squeeze()), columns = ['x', 'y'])
def find_threshold(df, plot = False):
SSRs, thresholds = [], []
for i in range(len(df) - 1):
threshold = df.x[i:i+2].mean()
low = df[(df.x <= threshold)]
high = df[(df.x > threshold)]
guess_low = low.y.mean()
guess_high = high.y.mean()
SSRs.append(SSR(low.y.to_numpy(), guess_low) + SSR(high.y.to_numpy(), guess_high))
thresholds.append(threshold)

if plot:
plt.scatter(thresholds, SSRs, s = 3)
plt.show()

return thresholds[SSRs.index(min(SSRs))]
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创建子节点

在将数据分成两个部分后就可以为低值和高值找到单独的阈值。需要注意的是这里要增加一个停止条件;因为对于每个节点,属于该节点的数据集中的点会变少,所以我们为每个节点定义了最小数据点数量。如果不这样做,每个节点将只使用一个训练值进行预测,会导致过拟合。

可以递归地创建节点,我们定义了一个名为TreeNode的类,它将存储节点应该存储的每一个值。使用这个类我们首先创建根,同时计算它的阈值和预测值。然后递归地创建它的子节点,其中每个子节点类都存储在父类的left或right属性中。

在下面的create_nodes方法中,首先将给定的df分成两部分。然后检查是否有足够的数据单独创建左右节点。如果(对于其中任何一个)有足够的数据点,我们计算阈值并使用它创建一个子节点,用这个新节点作为树再次调用create_nodes方法。

class TreeNode():
def __init__(self, threshold, pred):
self.threshold = threshold
self.pred = pred
self.left = None
self.right = None
def create_nodes(tree, df, stop):
low = df[df.x <= tree.threshold]
high = df[df.x > tree.threshold]

if len(low) > stop:
threshold = find_threshold(low)
tree.left = TreeNode(threshold, low.y.mean())
create_nodes(tree.left, low, stop)

if len(high) > stop:
threshold = find_threshold(high)
tree.right = TreeNode(threshold, high.y.mean())
create_nodes(tree.right, high, stop)

threshold = find_threshold(df)
tree = TreeNode(threshold, df.y.mean())
create_nodes(tree, df, 5)
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这个方法在第一棵树上进行了修改,因为它不需要返回任何东西。虽然递归函数通常不是这样写的(不返回),但因为不需要返回值,所以当没有激活if语句时,不做任何操作。

在完成后可以检查此树结构,查看它是否创建了一些可以拟合数据的节点。 这里将手动选择第一个节点及其对根阈值的预测。

plt.scatter(x, y, s = 0.5, label = 'Data')
plt.plot([tree.threshold]*2, [-16, 10], 'r--', 
label = 'Root threshold')
plt.plot([tree.right.threshold]*2, [-16, 10], 'g--', 
label = 'Right node threshold')
plt.plot([tree.threshold, tree.right.threshold], 
[tree.right.left.pred]*2,
'g', label = 'Right node prediction')
plt.plot([tree.left.threshold]*2, [-16, 10], 'm--', 
label = 'Left node threshold')
plt.plot([tree.left.threshold, tree.threshold], 
[tree.left.right.pred]*2,
'm', label = 'Left node prediction')
plt.plot([tree.left.left.threshold]*2, [-16, 10], 'k--',
label = 'Second Left node threshold')
plt.legend()
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这里看到了两个预测:

  • 第一个左节点对高值的预测(高于其阈值)
  • 第一个右节点对低值(低于其阈值)的预测

这里我手动剪切了预测线的宽度,因为如果给定的x值达到了这些节点中的任何一个,则将以属于该节点的所有x值的平均值表示,这也意味着没有其他x值参与 在该节点的预测中(希望有意义)。

这种树形结构远不止两个节点那么简单,所以我们可以通过如下调用它的子节点来检查一个特定的叶子节点。

tree.left.right.left.left
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这当然意味着这里有一个向下4个子结点长的分支,但它可以在树的另一个分支上深入得多。

预测

我们可以创建一个预测方法来预测任何给定的值。

def predict(x):
curr_node = tree
result = None
while True:
if x <= curr_node.threshold:
if curr_node.left: curr_node = curr_node.left
else: 
break
elif x > curr_node.threshold:
if curr_node.right: curr_node = curr_node.right
else: 
break

return curr_node.pred
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预测方法做的是沿着树向下,通过比较我们的输入和每个叶子的阈值。如果输入值大于阈值,则转到右叶,如果小于阈值,则转到左叶,以此类推,直到到达任何底部叶子节点。然后使用该节点自身的预测值进行预测,并与其阈值进行最后的比较。

使用x = 3进行测试(在创建数据时,可以使用上面所写的函数计算实际值。-3**2+3+5 = -1,这是期望值),我们得到:

predict(3)
# -1.23741
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计算误差

这里用相对平方误差验证数据

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def RSE(y, g): 
return sum(np.square(y - g)) / sum(np.square(y - 1 / len(y)*sum(y)))
x_val = np.random.uniform(-2, 5, 50)
y_val = np.array( [f(i) for i in x_val] ).squeeze()
tr_preds = np.array( [predict(i) for i in df.x] )
val_preds = np.array( [predict(i) for i in x_val] )
print('Training error: {:.4f}'.format(RSE(df.y, tr_preds)))
print('Validation error: {:.4f}'.format(RSE(y_val, val_preds)))
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可以看到误差并不大,结果如下

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概括的步骤

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更深入的模型

一个更适合回归树模型的数据:因为我们的数据是多项式生成的数据,所以使用多项式回归模型可以更好地拟合。我们更换一下训练数据,把新函数设为

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def f(x):
mu, sigma = 0, 0.5
if x < 3: return 1 + np.random.normal(mu, sigma, 1)
elif x >= 3 and x < 6: return 9 + np.random.normal(mu, sigma, 1)
elif x >= 6: return 5 + np.random.normal(mu, sigma, 1)

np.random.seed(1)

x = np.random.uniform(0, 10, num_points)
y = np.array( [f(i) for i in x] )
plt.scatter(x, y, s = 5)
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在此数据集上运行了上面的所有相同过程,结果如下

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比我们从多项式数据中获得的误差低。

最后共享一下上面动图的代码:

import pandas as pd
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from matplotlib.animation import FuncAnimation
#===================================================Create Data
def f(x):
mu, sigma = 0, 1.5
return -x**2 + x + 5 + np.random.normal(mu, sigma, 1)
np.random.seed(1)

x = np.random.uniform(-2, 5, 300)
y = np.array( [f(i) for i in x] )
p = x.argsort()
x = x[p]
y = y[p]
#===================================================Calculate Thresholds
def SSR(r, y): #send numpy array
return np.sum( (r - y)**2 )
SSRs, thresholds = [], []
for i in range(len(x) - 1):
threshold = x[i:i+2].mean()

low = np.take(y, np.where(x < threshold))
high = np.take(y, np.where(x > threshold))

guess_low = low.mean()
guess_high = high.mean()

SSRs.append(SSR(low, guess_low) + SSR(high, guess_high))
thresholds.append(threshold)
#===================================================Animated Plot
fig, (ax1, ax2) = plt.subplots(2,1, sharex = True)
x_data, y_data = [], []
x_data2, y_data2 = [], []
ln, = ax1.plot([], [], 'r--')
ln2, = ax2.plot(thresholds, SSRs, 'ro', markersize = 2)
line = [ln, ln2]
def init():
ax1.scatter(x, y, s = 3)
ax1.title.set_text('Trying Different Thresholds')
ax2.title.set_text('Threshold vs SSR')
ax1.set_ylabel('y values')
ax2.set_xlabel('Threshold')
ax2.set_ylabel('SSR')
return line
def update(frame):
x_data = [x[frame:frame+2].mean()] * 2
y_data = [min(y), max(y)]
line[0].set_data(x_data, y_data)
x_data2.append(thresholds[frame])
y_data2.append(SSRs[frame])
line[1].set_data(x_data2, y_data2)
return line
ani = FuncAnimation(fig, update, frames = 298,
init_func = init, blit = True)
plt.show()
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