磁碟進行讀寫操作的實體單位是：磁區。作業系統以磁區為單位對磁碟進行讀取/寫入操作，磁區是磁碟儲存資訊的最小實體單位。
磁區，是指磁碟上分割的區域。磁碟上的每個磁軌被等分為若干個弧段，這些弧段便是磁碟的磁區，硬碟的讀寫以磁區為基本單位。
磁碟的每一面被分成許多磁軌，即表面上的一些同心圓，越接近中心，圓就越小。
而每一個磁軌又以512個位元組為單位分成等分，叫做磁區，在一些硬碟的參數清單上你可以看到描述每個磁軌的磁區數的參數，它通常用一個範圍標識，例如373～746，這表示，最外圈的磁道有746個扇區，而最裡面的磁道有373個扇區，因此可以算出來，磁道的容量分別是從186.5KB到373KB(190976B--381952B)。
磁碟機在向磁碟讀取和寫入資料時，要以磁區為單位。
在磁碟上，DOS作業系統是以「群集」為單位為檔案指派磁碟空間的。硬碟的群集通常為多個磁區，與磁碟的種類、DOS 版本及硬碟分割區的大小有關。
每個簇只能由一個檔案佔用，即使這個檔案中有幾個字節，絕不允許兩個以上的檔案共用一個簇，否則會造成資料的混亂。
這種以簇為最小分配單位的機制，使硬碟對資料的管理變得相對容易，但也造成了磁碟空間的浪費，尤其是小檔案數目較多的情況下，一個上千兆的大硬碟，其浪費的磁碟空間可達上百兆位元組。
為了對磁區進行尋找與管理，需要將磁區編號，磁區的編號從0磁軌開始，起始磁區為1磁區，其後為2磁區、3磁區……，0磁軌的磁區編號結束後，1磁軌的起始磁區累計編號，直到最後一個磁軌的最後一個磁區（n磁區）。
例如，某個硬碟有1024個磁軌，每個磁軌分割為63個磁區，則0磁軌的磁區號為1~63，1磁軌的起始磁區號為64最後一個磁軌的最後一個扇區號為64512。
硬碟在進行磁區編號時與磁碟區有一些區別，在磁碟機的磁軌中，磁區號一次編排，即1、2、3…n區。由於硬碟的轉速較高，磁頭在完成某個磁區資料的讀寫後，必須將資料傳送到微電腦，這需要一個時間，但是這時硬碟在繼續高速旋轉，當資料傳輸完成後，磁頭讀寫第二個磁區時，磁碟已經旋轉到了另一個磁區。因此在早期硬碟中，扇區號是按照某個間隔係數跳躍編排的。
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