Référez-vous aux réponses de @Leedy et @Evian et constatez qu'il y a un paramètre unshallow :

git fetch --help


--unshallow
           Convert a shallow repository to a complete one, removing all the limitations imposed by shallow repositories.

(Avez-vous résolu le problème dans les commentaires ?)

$ git version
git version 1.8.5.3

$ git help clone
...
       --depth <depth>
           Create a shallow clone with a history truncated to the specified
           number of revisions. A shallow repository has a number of
           limitations (you cannot clone or fetch from it, nor push from nor
           into it), but is adequate if you are only interested in the recent
           history of a large project with a long history, and would want to
           send in fixes as patches.
...

On peut voir que git Shallow Clone ne peut cloner que la structure de répertoires du Remote/HEAD actuel, à l'exclusion de l'historique, ce n'est donc pas un dépôt complet.

Cependant, Git 1.9/2.0 a supprimé cette limitation, voir https://github.com/git/git/commit/82fba2b9d39163a0c9b7a3a2f35964cbc039e1a.

Référence : http://stackoverflow.com/questions/6941889/is-git-clone-degree-1-shallow-clone-more-useful-than-it-makes-out

$ git fetch --help

--profondeur=<profondeur>

Approfondissez ou raccourcissez l'historique d'un référentiel superficiel créé par git clone avec l'option --degree= (voir git-clone(1)) jusqu'au nombre spécifié de commits à partir de la pointe de chaque historique de branche distante. Les balises pour les commits approfondis ne sont pas récupérées.

git fetch --profondeur=1000000

J'ai vu une solution sur stackoverflow, mais elle ne fonctionnait toujours pas après l'avoir essayée.
http://stackoverflow.com/questions/6802145/convert-shallow-clone-to-full-clone

git pull --unshallow