Quel logiciel est Rosetta ?

rosetta est un ensemble complet de logiciels pour simuler des structures macromoléculaires ; le logiciel a été écrit pour la première fois en FORTRAN en 1998 pour la prédiction abinitio de petites protéines, et a maintenant été réécrit en "C++" en tant que logiciel flexible et polyvalent. Les applications incluent des outils pour prédiction de la structure, conception et remodelage des protéines et des acides nucléiques.

L'environnement d'exploitation de ce tutoriel : système Windows 10, ordinateur DELL G3.

Qu'est-ce que Rosetta ?

Rosetta est un logiciel complet de simulation de structures macromoléculaires. Il a été écrit pour la première fois en FORTRAN en 1998 et utilisé pour la prédiction abinitio des petites protéines. Désormais réécrit en C++ en tant qu'application flexible et polyvalente, il comprend des outils de prédiction de structure, de conception et de remodelage de protéines et d'acides nucléiques. Le serveur Web de Rosetta a exécuté des milliards de simulations pour la prédiction de structures et la conception de protéines.

Les serveurs Web de Rosetta ont exécuté des milliards de simulations de prédiction de structure et de conception de protéines, et des milliards, voire des milliards, d'autres exécutées sur des clusters de superordinateurs.

Les chercheurs utilisent Rosetta pour mieux comprendre les traitements des maladies infectieuses, du cancer et des maladies auto-immunes. D'autres applications incluent le développement de vaccins, de nouveaux matériaux, de liants protéiques ciblés et la conception d'enzymes.

Rosetta était à l'origine un outil de prédiction de structure et a toujours donné de bons résultats dans la formation de prédiction aveugle à l'échelle de la communauté CASP. Il s'est développé pour fournir une variété d'algorithmes d'échantillonnage efficaces pour explorer le squelette, la chaîne latérale et l'espace de séquence, et ses avantages ont été généralisés à des exercices plus larges à l'échelle de la communauté, notamment les puzzles d'ARN et CAPRI. Rosetta a largement testé ses capacités de notation énergétique et englobe une gamme d'applications inégalée, du pliage à l'amarrage en passant par la conception.

Rosetta est disponible gratuitement pour les laboratoires universitaires et gouvernementaux, avec plus de 10 000 licences gratuites utilisées. Comprend également un forum actif. Pour télécharger Rosetta, veuillez demander une licence.

Si vous êtes prêt à essayer Rosetta, je vous recommande de commencer ici et d'essayer ces tutoriels.

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