假设表单如此：

<form action="upload_file.php" method="post"
enctype="multipart/form-data">
<label for="file">Filename:</label>
<input type="file" name="form_file_name" id="file" /> 
<br />
<input type="submit" name="submit" value="Submit" />
</form>

<?php
// 检查错误什么的就不写了
$filename = $_FILES['form_file_name']["tmp_name"];
$md5 = md5_file($filename);
$ext = pathinfo($_FILES['form_file_name']['name'], PATHINFO_EXTENSION);
move_uploaded_file($filename, $md5.'.'.$ext);
?>

这样可以换名字:
$str=’test.name’；
$pos=strrpos（$str,’.’）；
echo substr_replace（$str,md5（substr（$str,0,$pos））,0，$pos）;
手机写代码好费劲。。。