在此提出第三种方案，在 posts(文章) 集合中储存对该文章点赞的用户的 _id 的数组，例如：

// posts
{
    _id: ObjectID('4e7020cb7cac81af7136236b'),
    users_like_this_post: [
        ObjectID('4e7020cb7cac81af71362361'),
        ObjectID('4e7020cb7cac81af71362362')
    ]
}

查对一个文章点赞的用户：

post = db.posts.findOne({_id: ObjectID('4e7020cb7cac81af7136236b')});
console.log(post.users_like_this_post);

查一个文章的点赞数量：

post = db.posts.findOne({_id: ObjectID('4e7020cb7cac81af7136236b')});
console.log(post.users_like_this_post.length);

查点赞过 100 的文章：

posts = db.posts.find({'users_like_this_post.100': {$exists: true}});

查 user 点赞过的文章：

posts = db.posts.find({users_like_this_post: user._id});

user 对 post 点赞：

db.posts.update({_id: post._id}, {$addToSet: {users_like_this_post: user._id}});

user 对 post 取消点赞：

db.posts.update({_id: post._id}, {$pull: {users_like_this_post: user._id}});

PS: 以上代码未经测试，请自行参考文档进行测试。

建议后一种，因为，你应该还要统计每一个文章的点赞数量吧。