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Python多進程導入CSV至資料庫

Y2J
發布: 2017-05-06 14:54:36
原創
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本文要跟大家分享的是使用python實作多進程導入CSV檔案資料到MySQL的思路方法以及具體的程式碼分享,有相同需求的小夥伴可以參考下

前段時間幫同事處理了一個把CSV 資料匯入到MySQL 的需求。兩個很大的 CSV 文件, 分別有 3GB、2100 萬筆記錄和 7GB、3500 萬筆記錄。對於這個量級的數據,用簡單的單進程/單線程導入 會耗時很久,最終用了多進程的方式來實現。具體過程不贅述,記錄幾個要點:

  1. 批量插入而不是逐條插入

  2. 為了加快插入速度,先不要建造索引

  3. 生產者與消費者模型,主行程讀文件,多個worker 行程執行插入

  4. #注意控制worker 的數量,避免對MySQL 造成太大的壓力

  5. 注意處理髒資料導致的例外狀況

  6. ##原始資料是GBK 編碼,所以也要注意轉換成UTF-8

  7. 用click 封裝指令列工具


  8. ##具體的程式碼實作如下:
#!/usr/bin/env python
# -*- coding: utf-8 -*-

import codecs
import csv
import logging
import multiprocessing
import os
import warnings

import click
import MySQLdb
import sqlalchemy

warnings.filterwarnings('ignore', category=MySQLdb.Warning)

# 批量插入的记录数量
BATCH = 5000

DB_URI = 'mysql://root@localhost:3306/example?charset=utf8'

engine = sqlalchemy.create_engine(DB_URI)


def get_table_cols(table):
  sql = 'SELECT * FROM `{table}` LIMIT 0'.format(table=table)
  res = engine.execute(sql)
  return res.keys()


def insert_many(table, cols, rows, cursor):
  sql = 'INSERT INTO `{table}` ({cols}) VALUES ({marks})'.format(
      table=table,
      cols=', '.join(cols),
      marks=', '.join(['%s'] * len(cols)))
  cursor.execute(sql, *rows)
  logging.info('process %s inserted %s rows into table %s', os.getpid(), len(rows), table)


def insert_worker(table, cols, queue):
  rows = []
  # 每个子进程创建自己的 engine 对象
  cursor = sqlalchemy.create_engine(DB_URI)
  while True:
    row = queue.get()
    if row is None:
      if rows:
        insert_many(table, cols, rows, cursor)
      break

    rows.append(row)
    if len(rows) == BATCH:
      insert_many(table, cols, rows, cursor)
      rows = []


def insert_parallel(table, reader, w=10):
  cols = get_table_cols(table)

  # 数据队列,主进程读文件并往里写数据,worker 进程从队列读数据
  # 注意一下控制队列的大小,避免消费太慢导致堆积太多数据,占用过多内存
  queue = multiprocessing.Queue(maxsize=w*BATCH*2)
  workers = []
  for i in range(w):
    p = multiprocessing.Process(target=insert_worker, args=(table, cols, queue))
    p.start()
    workers.append(p)
    logging.info('starting # %s worker process, pid: %s...', i + 1, p.pid)

  dirty_data_file = './{}_dirty_rows.csv'.format(table)
  xf = open(dirty_data_file, 'w')
  writer = csv.writer(xf, delimiter=reader.dialect.delimiter)

  for line in reader:
    # 记录并跳过脏数据: 键值数量不一致
    if len(line) != len(cols):
      writer.writerow(line)
      continue

    # 把 None 值替换为 'NULL'
    clean_line = [None if x == 'NULL' else x for x in line]

    # 往队列里写数据
    queue.put(tuple(clean_line))
    if reader.line_num % 500000 == 0:
      logging.info('put %s tasks into queue.', reader.line_num)

  xf.close()

  # 给每个 worker 发送任务结束的信号
  logging.info('send close signal to worker processes')
  for i in range(w):
    queue.put(None)

  for p in workers:
    p.join()


def convert_file_to_utf8(f, rv_file=None):
  if not rv_file:
    name, ext = os.path.splitext(f)
    if isinstance(name, unicode):
      name = name.encode('utf8')
    rv_file = '{}_utf8{}'.format(name, ext)
  logging.info('start to process file %s', f)
  with open(f) as infd:
    with open(rv_file, 'w') as outfd:
      lines = []
      loop = 0
      chunck = 200000
      first_line = infd.readline().strip(codecs.BOM_UTF8).strip() + '\n'
      lines.append(first_line)
      for line in infd:
        clean_line = line.decode('gb18030').encode('utf8')
        clean_line = clean_line.rstrip() + '\n'
        lines.append(clean_line)
        if len(lines) == chunck:
          outfd.writelines(lines)
          lines = []
          loop += 1
          logging.info('processed %s lines.', loop * chunck)

      outfd.writelines(lines)
      logging.info('processed %s lines.', loop * chunck + len(lines))


@click.group()
def cli():
  logging.basicConfig(level=logging.INFO,
            format='%(asctime)s - %(levelname)s - %(name)s - %(message)s')


@cli.command('gbk_to_utf8')
@click.argument('f')
def convert_gbk_to_utf8(f):
  convert_file_to_utf8(f)


@cli.command('load')
@click.option('-t', '--table', required=True, help='表名')
@click.option('-i', '--filename', required=True, help='输入文件')
@click.option('-w', '--workers', default=10, help='worker 数量,默认 10')
def load_fac_day_pro_nos_sal_table(table, filename, workers):
  with open(filename) as fd:
    fd.readline()  # skip header
    reader = csv.reader(fd)
    insert_parallel(table, reader, w=workers)


if name == 'main':
  cli()
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