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如何使用核外技術有效管理 Pandas 中的大型資料集?

DDD
發布: 2024-12-13 06:42:14
原創
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How to Efficiently Manage Large Datasets in Pandas Using Out-of-Core Techniques?

使用Pandas 的大量資料工作流程:核心外管理

簡介

管理大型資料集是一個常見的挑戰在數據分析。本文探討了使用流行的 Python 資料操作庫 Pandas 處理不需要分散式處理但超出記憶體限制的「大數據」的最佳實踐。我們專注於記憶體太大的資料集的永久儲存、資料查詢和更新。

問題

我們如何建立管理大型資料集的工作流程支援以下任務的Pandas:

  1. 將平面檔案載入到持久的磁碟資料庫中結構
  2. 查詢資料庫以檢索資料以進行Pandas分析
  3. 修改Pandas 中的子集後更新資料庫

解決方案

資料儲存

資料儲存

資料儲存

資料儲存

資料儲存

資料儲存
  1. 考慮使用HDFStore,Pandas 中基於HDF5 的資料儲存格式。 HDF5 針對高效處理磁碟上的大型資料集進行了最佳化。 HDFStore 中的每個群組都可以表示特定的欄位子集,從而實現高效查詢和更新。
  2. 資料載入
  3. 要將平面檔案迭代載入到 HDFStore 中,請使用 chunk基於處理。批次讀取文件,根據字段映射追加到HDFStore中對應的分組,並建立資料列,實現高效分選。
  4. 查詢更新

要查詢和更新數據,請使用HDFStore的select()和append()方法。 select() 可讓您擷取行和列的特定群組或子集。 append() 可讓您將新資料新增至現有群組或為新欄位組合建立新資料。

    範例工作流程
  • 建立欄位對映來定義HDFStore 中的群組和資料列。
  • 逐塊讀取平面檔案。
  • 追加資料根據欄位對映進行分組,建立資料列以實現高效率查詢。

在 Pandas 中執行計算並建立新列。

將新欄位追加到 HDFStore,根據需要建立新群組。 使用子集數據進行後處理select_as_multiple().其他注意事項其他注意事項其他注意事項其他注意事項其他注意事項查詢並防止資料重疊。 使用索引在資料列上以提高行子集效能。 啟用壓縮以提高效率儲存。 考慮實作函數來抽象化資料結構並簡化資料存取。 透過利用 HDFStore 並採用這些最佳實踐,您可以建立一個強大的工作流程來管理大型資料集Pandas,能夠有效地儲存、查詢和更新超出記憶體限制的資料。

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來源:php.cn
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