これをカスタマイズする方法はありませんが、phpstudy の起動時にバージョンを切り替えることができます。たとえば、プログラム A には php バージョン 5.2 が必要で、プログラム A を開く必要がある場合はバージョン 5.2 に切り替え、プログラム B には 7.0 が必要です。 phpstudyを使っていたところ、バージョンが7.0に切り替わったため、他の方法はまだ見つかっていません。