主要是引用的使用，可以简化下测试：

• 有引用时：

$item1= array('id' => 1, 'pid' => 0, 'name' => '安徽省');
$item2= array('id' => 2, 'pid' => 0, 'name' => '浙江省');
$item3=array('id' => 3, 'pid' => 1, 'name' => '合肥市');
$tree[] = &$item1;//注意引用
$item1['son']=&$item2;//注意引用
$item2['son']=$item3;
print_r($tree);

• 无引用时：

$item1= array('id' => 1, 'pid' => 0, 'name' => '安徽省');
$item2= array('id' => 2, 'pid' => 0, 'name' => '浙江省');
$item3=array('id' => 3, 'pid' => 1, 'name' => '合肥市');
$tree[] = $item1;//注意无引用
$item1['son']=$item2;//注意无引用
$item2['son']=$item3;
print_r($tree);

有引用时子元素的改动都会在整个数组中展示出来，而无引用时，子元素的变动对整个数组没有影响。

没人么，求解释

是这样的, foreach 括号中的 items => a 和循环体中的 items => b 在内存中存在两个地方. 使用 & 之后, b 将会指向 a 即真正的 items.

但是在 php7 之后, foreach 变了一些 => php7 foreach 不向后兼容特性

引用赋值，就是说将赋值左边的直接指向内存中存储这个值的这块区域，而不是开辟一块新空间去接收数据的副本。

所以，在父子级别关系中，引用赋值直接将父元素中的['son']，直接指向了子元素的那片存储区，而并非只是存了值而已。每一个父元素都将['son']指向对应子元素的存储区，这样，其实在内存里已经连接形成了一个树形的结构，而由于所有的父元素里['son']都是指向了子元素的内存区，所以，输出数组中的父子关系和内存里的数据关系树基本上是一致的。

参考 @vishun

$items = array(
    1 => array('id' => 1, 'pid' => 0, 'name' => '安徽省'),
    2 => array('id' => 2, 'pid' => 0, 'name' => '浙江省'),
    3 => array('id' => 3, 'pid' => 1, 'name' => '合肥市'),
    4 => array('id' => 4, 'pid' => 3, 'name' => '长丰县'),
    5 => array('id' => 5, 'pid' => 1, 'name' => '安庆市'),
);

//&引用赋值在这儿如何理解？
$items[1]['son'][] = &$items[3];
$items[3]['son'][] = &$items[2];
print_r($items[1]);
//简化了结果，可以直接看son
//Array
//(
//    [id] => 1,[pid] => 0,[name] => 安徽省,
//    [son] => Array(
//        [0] => Array(
//            [id] => 3,[pid] => 1,[name] => 合肥市,
//            [son] => Array(
//                [0] => Array(
//                    [id] => 2,[pid] => 0,[name] => 浙江省
//                )
//            )
//        )
//    )
//)

//无限分级函数么？
function getTree($items){
    $tree = array();
    foreach($items as $item){
        if(isset($items[$item['pid']])){//关键是看这个判断，是顶级分组就给$tree，不是的话继续拼凑子分组（结合上述&用法）
            $items[$item['pid']]['son'][] = &$items[$item['id']];

        }else{
            $tree[] = &$items[$item['id']];
        }
    }
    return $tree;
}

看到了以上的回答，我还是想回答一下，引用再PHP里和指针在C／C++里的用法类似，相当于操作这个变量的指针，这样子的话，在函数里操作这个引用变量也就触发本身的变量更改。
引用能带来一些好处：因为是直接操作“指针”，效率很高，不会产生多余的内存浪费以及消耗开辟内存的性能；