我今天刚好遇到与楼主相同的问题，在5s上可以获取token，在6上却获取不了token。

原因如下：
    我在 didFinishLaunchingWithOptions:(NSDictionary *)launchOptions方法中判断是否登录的时候提前使用了 return YES  导致整个方法没有执行完，我把return去掉就解决问题了。
代码如下：
    //注册代码
        [JPUSHService registerForRemoteNotificationTypes:(UIUserNotificationTypeBadge |
                                                  UIUserNotificationTypeSound |
                                                  UIUserNotificationTypeAlert)
                                                  categories:nil];
    
        //导致有些设备获取不了token，有些设备能够获取token的代码
        if(![kUSER_DEFAULT boolForKey:kIS_LOGIN])
        {
            LoginViewController *loginVC   = [[LoginViewController alloc] init];
            self.window.rootViewController = loginVC;
            return YES; （把此return YES 删除）
        }
        return YES
        
    //获取token代码
    -(void)application:(UIApplication *)application didRegisterForRemoteNotificationsWithDeviceToken:(NSData *)deviceToken
    {
        HSLog(@"DeviceToken:%@", deviceToken]);
    }

didFailToRegisterForRemoteNotificationsWithError 这个回调里有任何提示吗？另外，你的设备都是在哪个版本的 iOS 系统？ 注册 APN 的代码方便贴出来吗？