不用考虑太多... 只需要关心几个问题就行.. 我遇到的就只有两个:

1.程序里面的文件夹不要用写死的 / 或者\ 来写.. 应该用File.pathSeparator 这样的话.. 就会根据系统来自己选择分隔符.
2. 文件编码(windows下面默认asc) 可能会有问题. 只需要将编码用统一的utf就好了..

在java版本一致的情况下, 其他的还没遇到过什么问题.

理论上（宣传文档上说的），兼容性的问题由java虚拟机处理了。class文件是跨平台的。窃以为，高级特性用多了，恐怕会有兼容性问题，虚拟机实现得不好呗。
穷人，没有mac试验。