L'initiative Chan Zuckerberg présente un nouveau modèle Gremln pour la génétique

Alphafold, dont les créateurs ont reçu un prix Nobel de science, est une réalisation historique, mais ce n'est que le début du rôle transformateur de l'IA en médecine, en particulier dans le domaine de la génétique.

Ce mois-ci apporte des nouvelles passionnantes de l'initiative Chan Zuckerberg, soutenue par Mark Zuckerberg et Priscilla Chan, dévoilant un système de pointe nommé Gremln (modèle neuronal à intégration de régulation des gènes), conçu pour décoder le comportement cellulaire.

Le modèle est prometteur pour faire progresser les études sur le cancer et s'attaquer à une gamme d'autres maladies.

Un élément clé du projet comprend des méthodes d'imagerie innovantes, ainsi que des outils pour soutenir les scientifiques du développement de logiciels.

De plus, CZ met en évidence un «ensemble de données monocellulaire» englobant 1 milliard de cellules, créé en collaboration avec la génomique 10X et la génomique Ultima. Selon la documentation disponible, cela signifie que les chercheurs ont compilé des informations à partir d'au moins un milliard de cellules individuelles pour construire un modèle complet représentant la structure et la fonction de la cellule moyenne.

Les experts pensent que le modèle Gremln pourrait aider à identifier les facteurs génétiques derrière les maladies et à découvrir de nouvelles stratégies pour retourner des cellules défectueuses à un état sain.

Quatre objectifs clés et obstacles

En annonçant cette ressource transformatrice, les représentants de la CZ ont décrit quatre objectifs scientifiques principaux:

Le premier consiste à créer une cellule virtuelle alimentée par AI - une tâche où Gremln devrait jouer un rôle central.

Le deuxième est l'avancement de nouvelles technologies d'imagerie capables de cartographier, de mesurer et de modéliser des systèmes biologiques complexes - un autre domaine étroitement aligné sur la vision de l'initiative.

Les équipes visent également à développer des méthodes pour détecter directement l'inflammation dans le corps et à tirer parti du système immunitaire humain pour diverses formes d'immunothérapie.

En regardant plus profondément, ces ambitions révèlent comment Gremln soutiendra l'exploration par CZ de ce qu'ils appellent la «logique moléculaire» - comprenant comment les différents composants cellulaires interagissent et fonctionnent comme un système unifié.

Que sont les biohubs?

L'annonce de Chan Zuckerberg fait également référence à la création de BioHubs - Research Laboratories conçu pour promouvoir l'innovation collaborative, décrite par les responsables comme «des institutions de recherche interdisciplinaires».

Selon Chatgpt, un BioHub est un centre de sciences collaboratifs axé sur l'accélération des découvertes biomédicales grâce au travail d'équipe interdisciplinaire, aux infrastructures partagées et à l'innovation ouverte.

«Généralement formé par des alliances entre les universités, les organismes de recherche, les systèmes de soins de santé, les entités gouvernementales et les chefs de technologie, les biohubs relèvent des défis de santé complexes en intégrant les connaissances à travers la biologie, la médecine, l'ingénierie, l'informatique et la science des données», explique l'IA. «Un exemple notable est le BioHub de Chan Zuckerberg, qui relie les chercheurs de Stanford, UCSF et UC Berkeley pour lutter contre les maladies infectieuses et élargir la compréhension biomédicale par le biais de la science à accès ouvert.»

Il précise également que les biohubs CZ diffèrent entièrement des biohubs de l'OMS.

«L'initiative de l'OMS est un effort distinct axé sur le partage mondial d'échantillons biologiques , tels que des virus à potentiel pandémique, parmi les pays membres. Bien que les deux utilisent le terme« biohub », leurs objectifs, leur gouvernance et leurs liens organisationnels ne sont pas complètement liés.»

Pourtant, l'idée sous-jacente est partagée: des scientifiques unisant à travers les disciplines pour repousser les limites de la connaissance, en particulier dans des domaines comme la structure de l'ADN nucléaire et mitochondrial.

Une plongée rapide dans la biologie cellulaire révèle des différences clés entre les types d'ADN dans une cellule.

La plupart de l'ADN réside dans le noyau, mais les mitochondries contiennent également leur propre matériel génétique, fonctionnant quelque peu indépendamment du génome central.

La littérature offre des informations

Les lecteurs familiers avec la jeune fiction adulte de Madeleine L'Engle des années 1980 se souviendront peut-être de son point de vue imaginatif de la vie subcellulaire et de son influence sur les systèmes plus grands.

Juste pour la curiosité, j'ai demandé à Chatgpt sur l'influence de L'Engle sur la génétique moderne et la recherche cellulaire.

«Madeleine L'Engle n'a pas directement prédit des résultats spécifiques en génétique ou en biologie mitochondriale», a-t-il répondu, «mais ses romans - en particulier une ride à temps (1962), un vent dans la porte (1973), et le reste du quintette de temps - Intentiesses scientifiques et philosophiques sur la fonction cellulaire, le mitochondra santé, l'interconnecté et le Cosmique. Présente les «Farandolaes», les êtres fictifs vivant à l'intérieur des mitochondries, dont le bien-être a un impact direct sur les organismes individuels et l'univers.

Combien de lecteurs rappellent les Farandolae - une métaphore des relations symbiotiques, un concept plus poétique que basé sur les données en son temps?

«Comme un utilisateur le note sur l'échange de piles de littérature», poursuit Chatgpt, «les jeunes Farandolaes ne peuvent pas assumer des rôles adultes, ils vivent donc parasitiquement de l'adulte Farae. Et sous l'influence de l'échtification, ils aiment réellement cette existence unilatérale - sans donner…» »»

En fin de compte, l'IA conclut:

«Bien qu'il ne soit pas scientifiquement normatif, la narration créative de L'Engle préfigurait les concepts modernes dans la génétique et la recherche mitochondriale, comme la coopération cellulaire, la dynamique énergétique, l'interdépendance systémique et le lien profond entre la biologie microscopique et la santé globale.»

Pousser la frontière en avant

Il est clair que ces efforts de collaboration permettent aux scientifiques de prendre des mesures plus proactives pour guérir les maladies.

J'ai trouvé ce développement qui mérite d'être mis en évidence lors de ce qui s'annonce comme une année marquante pour l'intelligence artificielle dans les soins de santé. Des diagnostics et de l'automatisation du flux de travail à la recherche fondamentale soutenant les progrès cliniques, les applications d'IA se développent rapidement.

C'est une victoire majeure pour la technologie. Pourtant, il y a encore de la place aux interprétations imaginatives, voire fictives, des systèmes biologiques - comme ceux du travail de L'Engle - qui mettent l'accent sur l'émerveillement et l'interconnectivité sur les détails techniques purs. Quelle est votre prise?

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